Anamika Ray

Zastosowanie technologii mikromacierzy Anamika Ray

Konstrukcja bibliotek cDNA jest przydatna do poznania ekspresji genów w organizmach w ró?nych warunkach, ale losowe sekwencjonowanie bezstronnych cDNA jest pracochlonne i prowadzi do redundancji. Naszym celem bylo wyizolowanie cDNA indukowanego przez przestawienie Aspergillus nidulans z glukozy na wybrane polisacharydy. Opracowali?my metod? hybrydyzacji z negatywn? subtrakcj?, która polegala na przesiewaniu biblioteki utworzonej z cDNA komórek hodowanych w wybranych warunkach fizjologicznych ze znakowanymi sondami cDNA z innych warunków fizjologicznych. W badaniach przesiewowych w poszukiwaniu transkryptów indukowanych zmian± ?ródla w?gla wyizolowano 3532 negatywy. Wykonano jednokanalowe eksperymenty mikromacierzowe, aby potwierdzic, ?e wi?kszo?c negatywów byla rzeczywi?cie indukowana w sposób zró?nicowany. Aby uzyskac wgl?d w regulacj?, u?yli?my mikromacierzy do identyfikacji zmian ekspresji genów po zmianie ?ródla w?gla z glukozy na pektyn? lub po glodówce glukozowej. Wyniki tych bada? ukazuj? u?yteczne wykorzystanie pot??nej technologii mikromacierzy do badania profilowania ekspresji genów w ró?nych warunkach fizjologicznych.